Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RRBP1Q9P2E9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRBP1Q9P2E9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms