Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1186.3 ms