Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GIN1Q9NXP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIN1Q9NXP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIN1Q9NXP7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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