Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC13Q9NSE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC13Q9NSE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms