Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPORSQ9NS56 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TOPORSQ9NS56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOPORSQ9NS56 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPORSQ9NS56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPORSQ9NS56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPORSQ9NS56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPORSQ9NS56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms