Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI5

NMRK2, Nicotinamide riboside kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK2Q9NPI5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NMRK2Q9NPI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMRK2Q9NPI5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK2Q9NPI5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NMRK2Q9NPI5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms