Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF304Q9HCX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF304Q9HCX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF304Q9HCX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms