Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF1Q9HCE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms