Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF1DQ9H5J8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1DQ9H5J8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms