Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF3Q9H4D5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF3Q9H4D5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms