Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCXQ9H320 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCXQ9H320 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms