Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTBN4Q9H254 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN4Q9H254 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN4Q9H254 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN4Q9H254 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms