Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM117Q9H0C3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM117Q9H0C3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM117Q9H0C3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms