Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRDL1Q9BU40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms