Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC1Q9BTX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC1Q9BTX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms