Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL2Q9BQD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms