Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL2Q99962 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms