Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHOX2BQ99453 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms