Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF12Q99081 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms