Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERD3LQ96RJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FERD3LQ96RJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms