Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN4Q96Q06 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN4Q96Q06 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLIN4Q96Q06 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLIN4Q96Q06 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms