Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms