Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC42Q96M95 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC42Q96M95 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC42Q96M95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1076.4 ms