Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKNOX2Q96KN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKNOX2Q96KN3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms