Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RNFT2Q96EX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNFT2Q96EX2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms