Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TIFAQ96CG3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIFAQ96CG3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms