Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCAF4Q8WV16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCAF4Q8WV16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCAF4Q8WV16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms