Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD1Q8TEB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD1Q8TEB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD1Q8TEB9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms