Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFWD2Q8NHY2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms