Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC197Q8NCU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC197Q8NCU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms