Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1Q8N0S2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1Q8N0S2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms