Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC170Q8IYT3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC170Q8IYT3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC170Q8IYT3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms