Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLRC3Q7RTR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms