Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDF2Q6PJF5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDF2Q6PJF5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms