Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKN3Q6P5Z2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms