Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFXN4Q6P4A7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFXN4Q6P4A7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms