Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms