Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF20Q5VT98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms