Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIN9Q5TKA1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms