Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC18Q5T9S5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC18Q5T9S5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC18Q5T9S5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms