Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP58Q5T655 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP58Q5T655 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP58Q5T655 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms