Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRIF1Q5T3J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIF1Q5T3J3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms