Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBM48Q5RL73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RBM48Q5RL73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM48Q5RL73 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms