Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB41Q5JT25 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB41Q5JT25 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms