Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM47AQ5JRC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47AQ5JRC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 434.4 ms