Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC178Q5BJE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC178Q5BJE1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms