Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAL1Q4LDG9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAL1Q4LDG9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms