Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP221Q4G0U5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP221Q4G0U5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms