Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKDC1Q2TB90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HKDC1Q2TB90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKDC1Q2TB90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms