Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZFHX3Q15911 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZFHX3Q15911 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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